Yoshiteru Konishi ha conquistato la pole position provvisoria alla Otto Ore di Suzuka, davanti alla Suzuki Yoshimura di Akira Watanabe ed alla Yamaha Blue Racing di Norick Haga.

La sessione di qualifiche della mattina si è svolta su pista asciutta, e nella maggior parte del tempo anche sotto un bel sole. Il tempo atteso per le qualifiche del pomeriggio è variabile, e la pioggerella nel pomeriggio ha iniziato a bagnare il circuito. In questo caso le sessioni di qualifica vengono dichiatare "bagnate", e non vale più la regola - tipica di Suzuka per la Otto Ore - di solo quattro set di gomme per le qualifiche.

Questo ha permesso l'uso di pneumatici da qualifica, che normalmente invece non sono usati, ma solo Konishi è riuscito a sfruttare questa opportunità migliorando il suo tempo di 1,5 secondi, unico pilota ad infrangere il muro di 2'09" nelle qualifiche.

Qualifiche provvisorie: Top Ten
1st 101 Toy Story Honda – JPN – Honda CBR1000RR – Y.Konishi – 2:09.176
2nd 12 Yoshimura Suzuki – JPN – A.Watanabe – Suzuki GSX-R1000 – 2:09.636
3rd 45 Yamaha Blue Racing – JPN – N.Haga – Yamaha YZF-R1 – 2:09.687
4th 778 FCC TSR Honda – JPN – Honda CBR1000RR – S.Itoh – 2:09.950
5th 48 FCC TSR Honda – JPN – Honda CBR1000RR – G.Kamada – 2:09.975
5th 39 Team Challenger Yamaha – JPN – Yamaha YZF-R1 – N.Osaki – 2:09.975
7th 04 Masked Rider Honda – JPN – Honda CBR1000RR – T.Yamaguchi – 2:10.018
8th 21 YSP & Presto Yamaha – JPN – Yamaha YZF-R1 – K.Nakasuga – 2:10.052
9th 7 Seven Stars Honda – JPN – Honda CBR1000RR – R.Kiyonari – 2:10.089
10th 11 Seven Stars Honda – JPN – Honda CBR1000RR – T.Okada – 2:10.199

Qualifiche provvisorie: Team permanenti
15th 1 Suzuki Castrol – FRA – Suzuki GSX-R1000 – V.Philippe – 2:11.795
38th 07 Yamaha Austria – AUT – Yamaha YZF-R1 – I.Jerman – 2:15.372
43rd 199 Yamaha Acropolis Zone Rouge BEL – Yamaha YZF-R1 – M.Nickmans – 2:15.730
47th 3 Yamaha Phase One Endurance GBR- Yamaha YZF-R1 – D.Cudlin – 2:15.957
50th 8 Kawasaki Bolliger – SUI – Kawasaki ZX10R – P.Muff – 2:16.348
58th 012: Suzuki Fagersjo-el.se – SWE – Suzuki GSX-R1000 – P Young – 2:17.658
59th 666 Kawasaki Diablo – GBR – Kawasaki ZX10R – J.Hutchins – 2:18.659
60th 6 Shell Endurance Academy – GBR – Yamaha YZF-R1 – A.Dubelski – 2:18.808
61st 44 Suzuki No Limits & RT – ITA – Suzuki GSX-R1000 – F.Jond – 2:19.334
62nd 100 Suzuki Endurance Moto45 – FRA – Suzuki GSX-R1000 – D.Briere – 2:19.761